哪些单位查员工案底
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可以查询员工案底的机关包括：
公安机关：
负责犯罪记录的保存和查询，包括普通公民的犯罪记录查询。
国家安全机关：
同样负责犯罪记录的查询。
人民检察院：
在办案过程中可以查询犯罪记录。
司法行政机关：
也具备查询犯罪记录的权限。
需要注意的是，普通用人单位在没有特殊法定程序的情况下，是不允许查询员工的个人犯罪记录的。如果企业需要了解员工是否有可能有过犯罪记录，可以在招聘过程中要求员工提供无犯罪记录证明。
此外，对于犯罪时不满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚的人，其犯罪记录应当被封存，用人单位一般无法查询到这类记录。
综上所述，可以查询员工案底的单位是公安机关、国家安全机关、人民检察院和司法行政机关，而普通用人单位在没有特殊法定程序的情况下是不允许查询员工的个人犯罪记录的。